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是管理国家自然科学基金的国务院直属事业单位。
自成立以来,在党、国务院的正确领导下,在国务院有关部门及全国科学家的支持下,科学基金工作突破了以往计划经济体制下科研经费依靠行政拨款的传统管理模式,全面引入和实施了先进的科研经费资助模式和管理理念,确立了“依靠专家、发扬民主、择优支持、公正合理”的评审原则,建立了“科学民主、平等竞争、鼓励创新”的运行机制,充分发挥了自然科学基金对我国基础研究的“导向、稳定、激励”的功能;健全了决策、执行、监督、咨询相互协调的科学基金管理体系,形成了以《国家自然科学基金条例》为核心、包括组织管理规章、程序管理规章、经费管理规章、监督保障规章在内的规章制度体系。
按照全面深化科技体制改革、实施创新驱动发展战略的总体部署,科学基金明确了“筑探索之渊、浚创新之源、延交叉之远、遂人才之愿”的战略使命,强调更加聚焦基础、前沿、人才,更加注重创新团队和学科交叉,全面培育源头创新能力。
国家自然科学基金委员会是科技部管理的部门。
2018年，根据党的十九届三中全会审议通过的《深化党和国家机构改革方案》、第十三届全国人民代表大会第一次会议审议批准的《国务院机构改革方案》有关精神：国家自然科学基金委员会由原国务院直属事业单位，改为由科学技术部管理的事业单位（副部级）。
由科学技术部管理。科学技术部负责管理国家自然科学基金委员会，依法对国家自然科学基金工作进行宏观管理、统筹协调和监督评估。
国家自然科学基金委员会依法管理国家自然科学基金，相对独立运行，负责资助计划、项目设置和评审、立项、监督等组织实施工作。
部级。国家自然科学基金委员会是管理国家自然科学基金的副部级事业单位，现由科学技术部管理，作为国家资助基础研究的主渠道，自1986年成立以来始终坚持“依靠专家、发扬民主、择优支持、公正合理”的评审原则，把握国家基础研究的战略定位，以增强源头创新能力、夯实科技强国建设的根基作为根本任务，在资助基础研究和科学前沿探索、培育科技创新人才和团队等方面发挥了重要作用。机关服务中心和科学基金杂志社（科学传播中心（筹））是国家自然科学基金委员会的直属事业单位，为科学基金事业发展提供支撑
国家自然科学基金委员会是管理国家自然科学基金的副部级事业单位，由科学技术部管理。科学技术部负责管理国家自然科学基金委员会，依法对国家自然科学基金工作进行宏观管理、统筹协调和监督评估。
国家自然科学基金委员会依法管理国家自然科学基金，相对独立运行，负责资助计划、项目设置和评审、立项、监督等组织实施工作。
国家自然科学基金委员会是正部级别的单位。
国家自然科学基金委员会负责国家自然科学的相关工作，每年要进行大的科学研究和划拨很多的资金，为我国的自然科学科研工作做出了突出的贡献。
副部级
国家自然科学基金委员会是管理国家自然科学基金的事业单位(副部级),按正常配置其主任行政级别是属于部级。 依据 <国务院关于中国地震局等机构设置的通知> 国家自然科学基金委员会由原国务院直属事业单位,改为由科学技术部管理的事业单位(副部级);全国社会保障基金理事会由原国务院直属事业单位改财政部管理。
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