根据国税总局2016年第17号公告的规定，纳税人跨县（市、区）提供建筑服务时，需遵循以下预缴税款规则：
1. 对于一般纳税人而言，若选择使用一般计税方法进行计税，则应基于其取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按2%的预征率计算应预缴的税款。
2. 同样作为一般纳税人，但若选择适用简易计税方法计税的情况，则应以相同方式计算——即从全部收入中扣除分包款项后，按照3%的征收率来确定应预缴的税额。
3. 小规模纳税人在跨县（市、区）提供服务时，也采取类似做法：首先确定总收入减去分包支出后的净额，然后依据3%的标准来计算所需缴纳的税款。
此外，还有一项特别规定指出，如果纳税人未能在应当开始预缴之日起六个月内完成相关税款的申报与缴纳工作，则将由机构所在地的主管国税机关依据《税收征收管理法》及其他相关法律法规对其进行处理。这旨在确保所有涉及跨区域建筑服务的税务活动都能按时准确地完成。
