在处理未申报的发票时，需要根据具体情况进行分类管理：
1、如果在认证当月发现申报表未报，可以重新提交申报表。逾期提交申报表，会被要求缴纳一定金额的滞纳金。
2、跨月未申报情况的处理：
1、如果由于自然灾害、办税人员伤亡、突发疾病或擅自离职等不可抗力原因导致未申报，可以向税务局提交书面的情况说明，并申请补申报。
2、如果是由于办税人员的主观原因，如忘记或申报漏报等，由于目前发票没有抵扣期限，因此可以选择将未抵扣的发票放到后期继续抵扣。
