根据《最高人民法院关于适用〈全国人民代表大会常务委员会关于惩治虚开、伪造和非法出售增值税专用发票犯罪的决定〉的若干问题的解释》的规定，虚开增值税专用发票的行为包括：
1.没有货物购销或者没有提供或接受应税劳务而为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具增值税专用发票；
2.有货物购销或者提供或接受了应税劳务但为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具数量或者金额不实的增值税专用发票；
3.进行了实际经营活动，但让他人为自己代开增值税专用发票。
因此，超过认证期限而未认证的增值税专用发票无法取得《开具红字增值税专用发票通知单》也就无法开具红字增值税专用发票，并不构成虚开增值税专用发票的行为。
1.超过90天认证期限未认证的增值税专用发票无法取得《开具红字增值税专用发票通知单》也就无法开具红字增值税专用发票。
2.对于超期发票，纳税人无法再通过开具红字增值税专用发票的方式进行处理。
3.根据《中华人民共和国税收征收管理法》的规定，纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还。
4.纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还。
因此，对于超期发票，纳税人可以向税务机关申请退还多缴的税款，或者留抵下期税款。
1.根据《中华人民共和国税收征收管理法》的规定，纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还。
2.纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还。
因此，对于因超期发票导致的多缴税款，纳税人可以在三年内向税务机关申请退税，并要求加算银行同期存款利息。
同时，纳税人也可以选择在以后的纳税期内将多缴的税款留抵下期税款，以减少未来的应纳税额。
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