通常情况下，员工的个人所得税应在其收入来源地缴纳。然而，如果员工在当地未能完成缴税，他们可以选择回到户籍所在地进行申报和缴纳。根据《国家税务总局稽查局关于中国移动税收专项检查有关问题的通知》（稽便函[2008]115号）文件第三条第（九）项的规定，对于派遣员工扣缴义务人的问题有明确的指导原则。该条款指出，当派遣方和用工单位都向员工支付薪资时，两者均被视为扣缴义务人，需依法履行扣缴税款的责任。同时，个人也需按规定向主管税务机关进行自行纳税申报。若只有一方支付薪资，那么支付方即为扣缴义务人，负责代扣代缴员工的个人所得税。
