1. 纳税方式的差异：
个体户通常采用核定征收的方式，即税务部门根据预先设定的定额进行征税，因此纳税金额是固定的。相比之下，小规模纳税人公司则采取查账征收的方式，每种税种都有不同的税率，最终缴税金额不是固定的。
2. 经营风险的不同：
个体户通常承担无限连带责任，这意味着如果发生任何问题，可能需要用个人所有财产进行赔偿。而小规模纳税人注册为有限公司时，其责任仅限于出资额，不会倾家荡产，责任范围相对较小。
