个体户确实可以签订三方协议。
通常情况下，企业需要与当地税务主管部门的管理员进行联系。税务局会提供打印好的协议给企业，由企业的办税人员填写相关内容。其中最关键的是要有扣税银行（通常由当地税务局指定）的扣税专用账号。在填写完毕后，盖上公章，再到银行去盖好印章，这样就算完成了整个流程。一式三份，分别由税务局、银行和企业各保留一份。
一旦签订了三方协议，每月月初就需要登录税务局的申报网站。根据上月的实际经营情况和税金的实际情况，填写相应的申报资料。审核无误后点击申报，税务终端审核通过后，就会从银行账户中划走应交的税金。
