并非所有地区都会征收水利建设基金。如果企业在电子税务局发现本期需要缴纳该基金，那么具体的申报流程如下：首先，企业税务人员应登录电子税务局系统，在主界面选择“税费申报及缴纳”选项，然后进入“附加税综合申报”页面。接下来，点击“填写申报表”，并仔细核对税款所属期间。在表格中选择“水利建设基金”，并准确输入当月的不含税收入额。系统会自动根据输入的数据计算出相应的税额。确认无误后，填写经办人的姓名和身份证号码，然后点击“申报”。完成申报后，点击“扣款”，最后点击“确定”，完成整个申报过程。
