在建筑行业中，总机构直接管理的跨地区项目部需要按照实际经营收入的0.2%来预分企业所得税。这一过程可以按月或按季进行，并由总机构将税款预分给项目所在地。同时，项目部也需要向所在地主管税务机关进行预缴。
具体来说，对于跨省、自治区、直辖市和计划单列市设立的项目部，其预缴税款应按照项目实际经营收入的0.2%来计算，并同样可以按月或按季进行预分。然而，如果是非跨省的异地施工，国家并没有规定要预缴企业所得税。这意味着，在这种情况下，项目部可能不需要进行预缴税款的操作。
至于总机构，它需要扣除已经由项目部预缴的企业所得税后的余额，然后在机构所在地进行预缴。这是为了确保整个建筑企业的税务合规性。
