根据《企业所得税法实施条例》第九条的规定，企业在计算应纳税所得额时，必须遵循权责发生制的原则。这意味着，所有属于当期的收入和费用，无论款项是否已经收付，都应当计入当期；而不属于当期的收入和费用，即使款项已经在当期收付，也不得计入当期。这一原则是普遍适用的，但若有本条例或国务院财政、税务主管部门的其他特别规定，则需按照这些特殊规定执行。
因此，对于第一年的发票，不能在第二年进行扣除。这是因为，如果将不属于当期的收入和费用计入了当期，那么会导致企业的利润虚增，从而增加企业的税负。这种做法不仅违反了权责发生制的原则，也不符合税法的精神。因此，企业在处理发票和税务问题时，必须严格遵守相关规定，确保财务报表的真实性和准确性。
